המחלקה מתמחה בהידרוגיאולוגיה ישומית לשיקום מי תהום מזוהמים, השפלת מי תהום, ניהול אקוויפרים, ותכנון בארות ומערכי הפקה, החדרה וניטור.
בנוסף, המחלקה עוסקת בעריכת סקרים וחוות דעת להגנה על מי התהום ובניהול נגר עירוני.
למחלקת הידרוגיאולוגיה באקולוג ניסיון רב שנים בפרויקטים מגוונים בארץ ובעולם, והיא כוללת אנשי מקצוע בעלי תארים מתקדמים העושים שימוש במערכות לניתוח נתונים, מודלים נומריים, פלטפורמת GIS, וציוד מדידה וניטור, על מנת לתת ללקוחותיה את הפתרונות האמינים, הכלכליים והמהירים ביותר.
